Bioinformatique avec Python et Biopython
Existe au format livre et ebook
La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. L’objectif de cet ouvrage est de montrer par l’exemple des scripts Python et Biopython et d’établir un lien avec le concept biologique afférent, afin que le lecteur...
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Présentation du livre
La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. L’objectif de cet ouvrage est de montrer par l’exemple des scripts Python et Biopython et d’établir un lien avec le concept biologique afférent, afin que le lecteur puisse développer ses propres scripts ou adapter ceux existants.
Le langage Python, par sa simplicité d’apprentissage, est particulièrement utilisé pour développer des applications. Biopython est un ensemble de scripts et d’outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.
Sommaire de l'ouvrage
- Dénombrement des nucléotides et calculs associés.
- Écriture de séquences d’acides nucléiques.
- Séquences et expressions régulières.
- Recherches bibliographiques dans PubMed.
- Profil PFAM d’une famille de protéines.
- Profil d’hydrophobicité d’une protéine – fenêtre de taille variable.
- Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure.
- Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée.
- Diagrammes de Ramachandran.
- Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D.
- Superposition de structures protéiques.
- Les protéines ou régions intrinsèquement désordonnées.
- Alignements avec BLAST de séquences et protéines homologues.
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1 Compléments
Auteur(s) de l'ouvrage
Caractéristiques du livre
Pages
224 pages
Format
169 x 240 mm
Collection
Sciences Sup
Parution
janvier 2024
Marque
Dunod
Public
De Bac à Bac +3
EAN
9782100858873
EAN Ebook : Pdf
9782100868629