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  • Bioinformatique avec Python et Biopython
Je découvre un extrait du livre

Bioinformatique avec Python et Biopython

Emmanuel Jaspard, Gilles Hunault
La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. Les domaines dits en omique (génomique, métagénomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique…), compte-tenu de la très grande quantité et complexité des données...
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Parution : 
janvier 2024
Collection : 
Sciences Sup
Marque : 
Dunod
Logo dunod Fiche
À paraître
Parution : janvier 2024
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lorsque cet ouvrage sera disponible
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Accès rapide
  • Présentation
  • Sommaire
  • Auteur(s)
  • Caractéristiques

Présentation du livre

La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. Les domaines dits en omique (génomique, métagénomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique…), compte-tenu de la très grande quantité et complexité des données biologiques à collecter et analyser, nécessitent des outils bioinformatiques.
Python, par sa simplicité d’apprentissage, est un langage particulièrement utilisé pour développer des applications.
Biopython est un ensemble d'outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.
Cet ouvrage construit sur le principe « une question de biologie, une réponse en programmation Python – Biopython  » permettra à l’étudiant en sciences de la vie d’appréhender différents aspects de la bioinformatique à travers le prisme de ces outils.
L’objectif principal de cet ouvrage est de comprendre la logique de ces scripts et d'établir un lien avec le concept biologique afférent afin que le lecteur puisse développer ses propres scripts ou adapter ceux existants.
Tous les scripts de l’ouvrage sont accessibles librement. 

Sommaire de l'ouvrage

Dénombrement des nucléotides et calculs associés. Ecriture de séquences d’acide nucléique. Séquences et expressions régulières. Recherches bibliographiques dans PubMed. Profil d’une famille de protéines. Profil d’hydrophobicité d’une protéine - fenêtre de taille variable. Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure. Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée. Diagrammes de Ramachandran. Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D. Superposition de structures protéiques

Auteur(s) de l'ouvrage

  • Jaspard Emmanuel
    Emmanuel Jaspard
    Enseignant-chercheur au département de Biologie - UFR Sciences, Université d’
  • Hunault Gilles
    Gilles Hunault
    Ancien maître de conférences de l'université d'Angers

Caractéristiques du livre

Pages
224 pages
Format
170 x 240 mm
Collection
Sciences Sup
Parution
janvier 2024
Marque
Dunod
Public
De Bac à Bac +3
EAN
9782100858873

EAN Ebook : Pdf

9782100868629

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